所有进境动物及其产品的检疫审批均由国家质检总局审批程序
1.代理报检单位注册登记程序：在所在地辖区直属检验检疫局提出申请并提交相关材料——直属局初审——符合条件报国家质检总局审核——合格颁发《代理报检单位注册登记证书》——在国家质检总局批准的区域内从事代理报检业务
2.入境货物检验检疫的程序：先放行通关后进行检验检疫，即：报检——受理报检并计费——签发《入境货物通关单》——通关——检验检疫
3.出境货物检验检疫的程序：先检验检疫，后放行通关，即：报检——受理报检并计费——实施检验检疫——产地和报关地一致的出具《出境货物通关单》，不一致的出具《出境货物换证凭单》，由报关地检验检疫机构换发《出境货物通关单》
4.出口小型气体容器的包装报检程序：生产企业事先向当地检验检疫机构办理注册登记——根据《出口商品质量许可证管理办法》考核——合格获得出口商品质量许可证——取得商品质量体系合格证书——向检验检疫机构申请出口危险货物小型气体容器的包装检验——报检——检验检疫机构根据《海运出口危险货物小型气体容器包装检验规程》和《国际海运危险货物规则》对包装进行性能检验——合格签发《出境货物运输包装性能检验结果单》
5.进境集装箱报检及检验检疫工作程序：在报关前报检——填写《出/入境集装箱报检单》——实施检验检疫——签发《集装箱检验检疫结果单》
6.携带伴侣动物的检疫程序：口岸检验检疫机构对其进行30天的隔离——合格签发检验检疫证书准予入境
7.检验检疫证书的签发程序包括审核、制证、校对、签署和盖章、发证/放行
8.进出口化妆品标签的申请程序：在报检前90个工作日向国家质检总局指定的检验检疫提出标签审核申请——审核——合格由国家质检总局颁发《进出口化妆品标签审核证书》
9.进出口食品标签的申请程序：在出口前提出食品标签审核申请——初审——初审结果报国家质检总局审批——符合颁发《进出口食品标签审核证书》
10.强制性产品认证的申请程序：认证申请和受理——型式实验——工厂审核——抽样检测——认证结果评价和批准——获得认证后的监督
11.出入境快件检验检疫的登记备案程序：申请——审核——合格颁发《出入境快件运营人检验检疫备案登记证书》
12.进出口电池产品汞含量检验监管备案的申请程序：申请备案——提交申请表及各种资料——受理申请——审核——不含汞的电池产品获取《进出口电池产品备案书》;含汞的进行专项检测，“汞含量检测实验室”出具的《电池产品汞含量检测合格确认书》，检验检疫机构凭此证审核换发《进出口电池产品备案书》
13.进境动物和动物产品一般检疫审批的申请程序：填写《中华人民共和国进境动植物检疫许可证申请表》——初审(口岸或使用地检验检疫局)——国家质检总局审批——合格签发《中华人民共和国进境动植物检疫许可证》
14.进境动物和动物产品特许检疫审批的申请程序：提交有关证明——领取申请表——报国家质检总局审批——决定批准的数量，提出检验检疫要求，指定进境口岸——核查监督
15.进境水果的检疫审批的程序：提出申请——直属局初审——国家质检总局审核——合格签发《中华人民共和国进境动植物检疫许可证》
16.进境栽培介质检疫审批的申请程序：提出申请(应在贸易合同或协议签定前办理检疫审批手续)——填写申请表——将样品每份1.5-5公斤送国家质检总局指定的实验室检验——出具有关检验结果和风险评估报告——合格，国家质检总局签发《中华人民共和国进境动植物检疫许可证》——到口岸检验检疫机构申请注册登记——合格签发注册登记证
17.进口涂料检验登记备案的申请程序：提前2个月提出申请——备案机构在5个工作日内审核签发《进口涂料备案申请受理情况通知书》——受理申请——将样品送至指定的专项检测实验室检验——实验室在15个工作日内完成检测——将检测报告提交备案机构——备案机构在3个工作日内进行审核——合格签发《进口涂料备案书》
18.出口观赏鱼饲养场/中转包装场注册登记的申请程序：向直属局提出注册登记申请——提交申请表和相关资料——直属局审核、评定——合格颁发《出口观赏鱼饲养场/中转包装场注册登记证》并报国家质检总局备案
19.供港澳活牛检验检疫注册的申请程序：提交申请表和资料——直属局考核——合格予以注册——颁发《供港澳活牛检验检疫注册证》
20.出口食用饲用饲料登记备案的申请程序：提交申请表和相关资料——直属局在15个工作日内进行审核——受理申请——对样本检测——合格予以登记备案——颁发《出口食用动物饲料生产企业登记备案证》
21.出口食品生产企业卫生注册登记的申请程序：提交申请书和相关资料——评审组在10个工作日进行审核——评审组长向直属检验检疫提交评审报告——在15个工作日内作出审核结果——合格批准签发《卫生注册证书》
22.出口烟花爆竹生产企业登记的申请程序：提交书面申请和相关资料——由2-3人的考核小组进行考核——合格直属检验检疫机构授予专用的登记代码(不合格的，整改后可申请复核，仍不合格的，半年后才可重新申请)
23.出口打火机、点火枪类商品生产企业登记程序：提交书面申请和相关材料——考核小组进行考核——合格由直属局颁发《出口打火机、点火枪类商品生产企业登记证》和专用的登记代码(不合格的，整改后可申请复核，仍不合格的，半年后才可重新申请)
24.出口商品质量许可证的申请程序：在当地检验检疫机构登记——申请质量许可证——填写申请书——检验检疫机构进行抽样检验产品——合格后由考核小组考核——合格批准发给质量许可证
25.出口商品运输包装容器生产企业质量许可证的申请程序：在当地检验检疫机构登记——填写申请表——检验检疫机构考核——合格颁发质量许可证——报国家质检总局备案
26.出口商品企业实施分类管理的申请程序：提出申请并提交相关材料——审核——符合一、二类的颁发证书
27.免检的申请程序：提出申请(进口商品免检向国家质检总局提出，出口商品免检先向所在地检验检疫局提出)——向国家质检总局提交《免检申请书》及相关资料——审核——1个月后做出书面答复意见
28.出入境检验检疫标志的申请程序：由申请人在报检时提出申请.
29.电子报检的工作程序：报检(先机审，后人审)企业发送电子报检数据——电子审单中心自动审核——符合传给受理报检人员——人工审核——符合反馈给报检单位和施检部门——受理报检——施检——计收费用——签证放行
30.出境电子转单的工作流程：产地检验检疫机构检验检疫合格——将信息传到电子转单中心——产地机构向出境关系人以书面方式提供报检单号、转单号及密码——出境关系人凭此申请《出境货物通关单》——出境检验检疫机构提取电子转单信息——签发《出境货物通关单》——把处理信息反馈到转单中心
31.入境电子转单的工作流程：口岸机构将信息传到电子转单中心——口岸机构将报检单号、转单号和密码以书面形式传给入境检疫关系人——目的地机构接收电子信息并反馈接收信息——入境关系人向目的地机构申请施检
