阴阳学说作为认识自然的一种方法论，在古代被广泛应用于各学科领域的研究。医学家们运用阴阳学说解释医学中的一切问题，并将阴阳学说与医学理论紧密结合起来。形成了医学的阴阳学说，并成为中医学理论体系不可分割的重要组成部分，也是贯穿于整个中医学理论体系的指导思想和重要的方法论。中医阴阳学说是以自然界运动变化的现象和规律，探讨人体的生理功能和病理变化的中医学基本理论。中医学正是运用这种规律来说明人体的生理活动、病理变化，并用以指导临床的诊断和治疗。
但必须指出：用阴阳来概括或区分事物的属性，必须是相互关联的一对事物，或是一个事物的两个方面，才具有实际的意义。
