黄檗的叶含黄酮类化合物达10%，从中分离出黄柏甙，去氢黄柏甙，黄柏环合甙，黄柏双糖甙，去氢黄柏双糖甙，去甲淫羊霍异黄酮次甙，异黄柏甙，去氢异黄柏甙，金丝桃甙。黄柏的叶还含有生物碱。此外还含有多糖，多糖经水解后阿拉伯糖含量约22%-23%，鼠李糖约30%，半乳糖和半乳糖醛酸约占47%左右。另外还分得a-（1-4）-链（半乳糖醛酸）半乳糖。
