(5)调节基因
tat 基因编码蛋白可与LTR结合，促进病毒所有基因的转录，也能在转录后促进病毒mRNA的翻译。聊基因产物是一种顺式激活因子，能对env和gag中顺式作用抑制序去抑制作用，增强pol、env和gag基因的表达，以合成相应的病毒结构蛋白。nef基因编码负调节蛋白对HIV基因的表达有负调控作用，以推迟病毒复制。该蛋白作用于HIVCDMA的LTR，抑制整合的病毒转录。是HIV在体内维持持续感染所必需。vpu基因对HIV-I并非必不可少，但可能影响游离HW感染性、病毒体的产生和体内扩散。vpu基因为HIV-I所特有，对HIV的有效复制及病毒体的装配与成熟是必需的。vpr基因编码蛋白是一种弱的转录激活物，在体内繁殖周期中起一定作用。
HIV-2基因结构与HIV-1有差别：它不含vpu基因，但有一功能不明的vpx基因。核酸杂交法检查HIV-2与HIV-1的核苷酸序列，仅40%相同。env基因表达产物激发机体产生的抗体无交叉反应。
