脏腑，是内脏的总称，也是藏象学说中的主要内容。以脏腑为基础，按照脏腑的生理功能特点，可分为三类：一是五脏，即心、肺、脾、肝、肾，二是六腑，即胆、胃、小肠、大肠、膀胱、三焦，三是奇恒之腑，即脑、髓、骨、脉、胆、女子胞(子宫)。
五脏主藏精气，以藏为主，藏而不泻，六腑传化水谷，传化物而不藏。正因为它们的功能特点不同，才分成了脏和腑两类脏器。而奇恒之腑，虽名为腑，但其功能有异于六腑，却具有类似于五脏贮藏精气的作用，具有似脏非脏，似腑非腑的特点。
五脏与形体诸窍联结成一个整体。五脏居于体内，但各有外候。五脏与形体诸窍各有其特定的联系，这是藏象学说整体观的又一具体体现。例如五脏与五体、官窍各有其相应的配合。根据藏象学说的理论，五脏的精气可以布散到五体与官窍之中，从而维持各器官组织的正常生理活动。五脏的生理活动与精神情志密切相关。人的精神情志与意识思维活动，是大脑的功能，是大脑对外界事物的客观反应。但在藏象学说中，则认为人的精神情志和意识思维活动与五脏的生理活动均具有密切的关系。由于五脏的生理活动直接影响着全身整体的生理功能，所以认为大脑的生理功能正常，有赖于五脏生理功能的平衡协调。五脏的功能活动异常，则大脑的精神情志和意识思维活动也必受其影响，反之，精神情志和意识思维活动的失常，也势必反作用于五脏，从而影响五脏的生理功能。因此，《素问·宣明五气篇》所说的“心藏神，肺藏魄，肝藏魂，脾藏意，肾藏志”等，并不是否认大脑的生理功能，而是进一步把人的精神意识和思维活动加以分类，并探讨其与各脏生理活动的关系。
