根据咽腔向前方的通道，可分为上、中、下三部，即鼻咽部、口咽部及喉咽部。
1．鼻咽部nasal part of pharynx
上起颅底，下至软腭平面，是鼻腔后部的直接延续，向前经鼻后孔通向鼻腔，咽顶呈拱状，称咽穹。后部粘膜内有丰富的淋巴组织，称咽扁桃体，在婴幼儿较发达，10岁后完全退化，有时婴儿可出现异常增大，叫增殖腺。
约在下鼻甲后方1厘米处，咽侧壁上有咽鼓管咽口，经咽鼓管通向中耳鼓室。在咽鼓管口的前、上、后方，明显隆起，称咽鼓管圆枕。圆枕后方与咽后壁之间有一纵行的隐窝，为咽隐窝，是鼻咽癌的好发部位之一，咽隐窝向上距破裂孔约1厘米，鼻咽癌的癌细胞可经破裂孔向颅内转移。
位于咽鼓管口周围的淋巴组织称为咽鼓管扁桃体。
2．口咽部oral part ofpharynx
为位于软腭和会厌上缘平面之间的咽腔，借咽峡通向口腔。当张口并将舌背向下压时，可经口腔观察到咽峡和咽后壁粘膜的色泽。舌根的后方为会厌，二者之间有三条纵行皱襞，外侧襞与正中襞之间有一对凹陷，称会厌谷，异物易在此处滞留。
腭帆两侧各有两对弧形向下的粘膜皱襞，前方的一对叫腭舌弓，其粘膜深面为腭舌肌。后方的一对叫腭咽弓，粘膜的深面为腭咽肌。前、后两弓之间的三角形凹陷，为扁桃体窝、容纳腭扁桃体。
腭扁桃体是一对淋巴器官，有防御功能，呈卵圆形，位于扁桃体窝内。腭扁桃体内侧面被覆粘膜，并有10－20个深陷的小凹陷，称扁桃体小窝。腭扁桃体上部实质内有一深的缝隙，称扁桃体上窝（扁桃体内裂隙）。扁桃体内面对向口腔、它的外侧面和前、后面均包被以薄层结缔组织膜，称扁桃体囊，囊借疏松结缔组织连于咽壁的内侧，故扁桃体及其被囊易于被剥离，腭扁桃体在出生后4－6个月内开始发育，至4－10岁最为发达，14－15岁以后又逐渐缩小。
腭扁桃体的血液供应丰富，上、下、前、后方分别有腭降动脉、面动脉、舌背动脉、和咽升动脉的扁桃体支供血。以上各动脉均属颈外动脉的分支，扁桃体摘除手术如大出血无法制止时，可结扎颈外动脉止血。
咽扁桃体、双侧咽鼓管扁桃体，双侧腭扁桃体和舌扁桃体共同形成一环形的咽淋巴环。.围绕在口、鼻腔与咽腔的通道周围，具有重要的防御作用和免疫功能。
