4、分子生物学检测
用PCR检测患者鼻咽分泌物百日咳杆菌DNA，具有快速、敏感、特异的诊断价值。
5、嘌呤环化酶（AC）活性检测
此法最大的优点是快速，且阳性率高，用于早期诊断有较大前途。异性抗体，主要用于回顾性诊断或不典型病例的辅助诊断；酶联免疫吸附试验可以测定百日咳特异性IgM、IgG、IgA抗体作为早期诊断的依据，对细菌培养阴性者更有意义。
