免疫应答过程各时相中自身MHC的限制作用更是说明机体在对外来抗原的识别和排斥时，均须以对自身抗原识别为基础。换句话说，在许多情况下，免疫细胞若不能识别自己，也就无法识别异已。
当自身免疫表现为质和量的异常，自身抗体和(或)自身致敏淋巴细胞攻击自身靶抗原细胞和组织，使其产生病理改变和功能障碍时，才形成自身免疫(autoimmune disease)。自身免疫与自身免疫病的关系可能有三种性况，①自身免疫引起疾病;②疾病引起自身免疫;③某些因素同时引前两者。
