事实上，价格是所有人关注的焦点。它是中国医改的核心内容之一。社会各方面争议颇多，而且难以达成共识。对于中国的医药企业来说，这个过程动荡难熬，不确定性很大。它们认为，现在的政策实质上不鼓励企业进行创新投入，因为很可能遭受降价的冲击，收不回成本。对于全社会而言，药价虚高仍然是一个大问题。这对决策者确实是一个考验。
中国外商投资企业协会药品研制与开发行业委员会执行总裁卓永清表示，由于只有20%的新药能够收回研发成本，国家需要制定一些面向医药企业的激励措施，使它们愿意承担新药研发的成本和风险。公平的定价有助于培育一个强大的、以创新为驱动力的医药行业。
他认为，当前“成本加成法”的定价模式无法准确反映研发的费用以及药品创新企业在药品研发过程中所承担的风险，不利于激励企业创新，并有可能将中国隔绝于全球创新体系之外，减少了中国患者获得优质药品的机会。在强制降价环境下对专利药品实施价格保护政策，使创新型企业有足够时间收回他们的研发投入，这是一项非常重要的保护机制。在中国药品的市场准入慢于其他国家的现实情况下，这一政策的实施显得尤为重要。
