事业单位的净资产是指资产减负债后的差额，具体包括事业基金、固定基金、专用基金、事业结余和经营结余等，其核算对比企业的所有者权益核算，有很大的差异，现归纳如下：
| 项目 | 内容 | |
| 基金 | 事业基金 | 事业基金是事业单位拥有的非限定用途的净资产，分为一般基金和投资基金两部分： ①一般基金：是指事业单位滚存的结余资金，主要有两个来源，一是从本单位当期期末分配结余转入；二是从拨入专款结余中按规定留归本单位使用的金额转入。例如，甲事业单位年末“结余分配”科目贷方余额200000元，应转入事业基金；拨入专款结余60000元，可全部留用本单位。账务处理是： 将“结余分配”中的有关数额转入“事业基金”： 借：结余分配 贷：事业基金——一般基金 将专款结余转入事业基金： 借：拨入专款 贷：事业基金——一般基金 60000 ②投资基金：是事业单位对外投资形成的基金，有两个来源，一是用货币资金、材料和无形资产对外投资时，从一般基金转入；二是用固定资产投资时从固定基金转入。前者是事业基金的一增一减，事业基金总额不变；后者从固定基金转入事业基金，事业基金增加，固定基金减少，但基金总额不变。具体可见上述例2。 |
| 固定基金 | 固定基金是指事业单位固定资产所占用的基金。固定基金通常随着固定资产账面余额的增减而发生相应的增减，两者金额通常相等；但是，在存在尚未付清租金的融资租入固定资产的情况下，两者的金额不同：固定资产应当在取得时按租赁协议确定的设备价款、运杂费、安装费等记账，而固定基金应当在支付租金时按照实际支付的金额入账。具体可见上述例3和例4。 | |
| 专用基金 | 专用基金是指事业单位按规定提取的具有专门用途的资金，包括职工福利基金、修购基金、医疗基金和住房基金等。 （1）专用基金来源 ①职工福利基金：从当年结余按规定比例提取： 借：结余分配——职工福利基金 贷：专用基金——职工福利基金 ②修购基金和医疗基金：按规定比例提取，列入事业支出、经营支出中： 借：事业支出（经营支出） 贷：专用基金——修购基金 专用基金——医疗基金 ③住房基金：收到住房基金时 借：银行存款 贷；专用基金——住房基金 对于个人住房公积金缴存情况，单位应设置辅助账簿进行登记。 （2）使用专用基金 借：专用基金——职工福利基金、修购基金、医疗基金 贷：银行存款 | |
| 结余 | 事业结余 | ①事业单位的结余是指事业单位在一定期间各项收入和支出相抵后的余额，主要包括事业结余和经营结余。 ②事业结余=（财政补助收入+上级补助收入+附属单位缴款+事业收入+其他收入）—（拨出经费+事业支出+上缴上级支出+非经营业务负担的销售税金+对附属单位补助） ③事业结余的账务处理：一是期末将有关事业收支类科目余额转入事业结余科目；二是将事业结余科目余额转入结余分配科目。详见例6。 |
| 经营结余 | ①经营结余=经营收入—（经营支出+经营业务负担的销售税金） ②经营结余的账务处理：一是期末将经营收支、经营业务负担的销售税金转入经营结余科目；二是将经营结余科目贷方余额转入结余分配科目，但如为亏损，则不予结转。详见例6。 | |
| 结余分配 | ①事业单位当年实现的结余，应当按照规定进行分配。结余分配的内容主要有两个：一是有所得税缴纳业务的事业单位计算应交所得税；二是事业单位计提专用基金（职工福利基金）。 ②进行结余分配后，对于当年未分配结余，应全部转入“事业基金——一般基金”。 | |
