hadoop核心逻辑shuffle代码分析-map端
首先要推荐一下:http://www.alidata.org/archives/1470
阿里的大牛在上面的文章中比较详细的介绍了shuffle过程中mapper和reduce的每个过程,强烈推荐先读一下。
不过,上文没有写明一些实现的细节,比如:spill的过程,mapper生成文件的partition是怎么做的等等,相信有很多人跟我一样在看了上面的文章后还是有很多疑问,我也是带着疑问花了很久的看了cdh4.1.0版本shuffle的逻辑,整理成本文,为以后回顾所用。
首先用一张图展示下map的流程:
在上图中,我们假设此次mapreduce有多个mapper和2个reducer,p0 p1分别代表该数据应该分配到哪个reducer端。我将mapper的过程大致分为5个过程。 1.prepare Input。Mapreduce程序都需要指定输入文件,输入的格式有很多种,最常见的是保存在hdfs上的文本文件。在用户提交job到jobtrack(ResourceManager)前的job就会根据用户的输入文件计算出需要多少mapper,多少reducer,mapper的输入InputSplit有多大,block块名称等。mapper在prepare input阶段只需要根据inputFormat类型创建对应的RecordReader打开对应的inputSplit分片即可。如果job配置了combiner还需初始化combiner。代码见MapTask类run方法 2.mapper process这里的mapper指用户使用或自己继承的mapper类,这也是所有初学mapreduce的同学首先看到的类。/** * Called once for each key/value pair in the input split. Most applications * should override this, but the default is the identity function. */ @SuppressWarnings("unchecked") protected void map(KEYIN key, VALUEIN value, Context context) throws IOException, InterruptedException { context.write((KEYOUT) key, (VALUEOUT) value); }可以看到mapper默认的map方法就是取出key,value并放到context对象中。context对象包装了一个内存中的buf,下面会介绍。
public void run(Context context) throws IOException, InterruptedException { setup(context); while (context.nextKeyValue()) { map(context.getCurrentKey(), context.getCurrentValue(), context); } cleanup(context); }run方法就是mapper实际运行的过程:不停的从context的inputSplit对象中取出keyvalue对,通过map方法处理再保存到context包装的内存buf中。 3.buffer in memery
partitions = job.getNumReduceTasks(); rfs = ((LocalFileSystem)FileSystem.getLocal(job)).getRaw(); //sanity checks final float spillper = job.getFloat(JobContext.MAP_SORT_SPILL_PERCENT, (float)0.8); final int sortmb = job.getInt(JobContext.IO_SORT_MB, 100); indexCacheMemoryLimit = job.getInt(JobContext.INDEX_CACHE_MEMORY_LIMIT, INDEX_CACHE_MEMORY_LIMIT_DEFAULT); if (spillper > (float)1.0 || spillper <= (float)0.0) { throw new IOException("Invalid \"" + JobContext.MAP_SORT_SPILL_PERCENT + "\": " + spillper); } if ((sortmb & 0x7FF) != sortmb) { throw new IOException( "Invalid \"" + JobContext.IO_SORT_MB + "\": " + sortmb); } sorter = ReflectionUtils.newInstance(job.getClass("map.sort.class", QuickSort.class, IndexedSorter.class), job);partition:mapper的数据需要分配到reduce端的个数,由用户的job指定,默认为1.spillper:内存buf使用到此比例就会触发spill,将内存中的数据flush成一个文件。默认为0.8sortmb:内存buf的大小,默认100MBindexCacheMemoryLimit:内存index的大小。默认为1024*1024sorter:对mapper输出的key的排序,默认是快排 内存buffer比较复杂,贴一张图介绍一下这块内存buf的结构:当一对keyvalue写入时首先会从wrap buf的右侧开始往左写,同时,会把一条keyvalue的meta信息(partition,keystart,valuestart)写入到最左边的index区域。当wrap buf大小达到spill的触发比例后会block写入,挖出一部分数据开始spill,直到spill完成后才能继续写,不过写入位置不会置零,而是类似循环buf那样,在spill掉数据后可以重复利用内存中的buf区域。 这里单独讲一下partition:
@Override public void write(K key, V value) throws IOException, InterruptedException { collector.collect(key, value, partitioner.getPartition(key, value, partitions)); }
在keyvalue对写入MapOutputBuffer时会调用partitioner.getPartition方法计算partition即应该分配到哪个reducer,这里的partition只是在内存的buf的index区写入一条记录而已,和下一个部分的partition不一样哦。看下默认的partitioner:HashPartition
/** Use {@link Object#hashCode()} to partition. */ public int getPartition(K key, V value, int numReduceTasks) { return (key.hashCode() & Integer.MAX_VALUE) % numReduceTasks; }
HashPartition只是把key hash后按reduceTask的个数取模,因此一般来说,不同的key分配到哪个reducer是随即的!所以,reducer内的所有数据是有序的,但reducer之间的数据却是乱序的!要想数据整体排序,要不只设一个reducer,要不使用TotalOrderPartitioner!
4.Partition Sort Store在第四步中,partition是和sort一起做的,负责Spill的线程在拿到一段内存buf后会调用QuickSort的sort方法进行内存中的快排。sorter.sort(MapOutputBuffer.this, mstart, mend, reporter);排序的算法是先按keyvalue记录的partition排序后按key的compare方法:
public int compare(final int mi, final int mj) { final int kvi = offsetFor(mi % maxRec); final int kvj = offsetFor(mj % maxRec); final int kvip = kvmeta.get(kvi + PARTITION); final int kvjp = kvmeta.get(kvj + PARTITION); // sort by partition if (kvip != kvjp) { return kvip - kvjp; } // sort by key return comparator.compare(kvbuffer, kvmeta.get(kvi + KEYSTART), kvmeta.get(kvi + VALSTART) - kvmeta.get(kvi + KEYSTART), kvbuffer, kvmeta.get(kvj + KEYSTART), kvmeta.get(kvj + VALSTART) - kvmeta.get(kvj + KEYSTART)); }因此,mapper输出的keyvalue首先是按partition聚合。而我们如果指定key的compare方法会在这里生效并进行排序。最后,一次spill的输出文件类似下图。在对内存中的buf排序后开始写文件。
for (int i = 0; i < partitions; ++i) { IFile.Writer<K, V> writer = null; try { long segmentStart = out.getPos(); writer = new Writer<K, V>(job, out, keyClass, valClass, codec, spilledRecordsCounter); if (combinerRunner == null) { // spill directly DataInputBuffer key = new DataInputBuffer(); while (spindex < mend && kvmeta.get(offsetFor(spindex % maxRec) + PARTITION) == i) { final int kvoff = offsetFor(spindex % maxRec); key.reset(kvbuffer, kvmeta.get(kvoff + KEYSTART), (kvmeta.get(kvoff + VALSTART) - kvmeta.get(kvoff + KEYSTART))); getVBytesForOffset(kvoff, value); writer.append(key, value); ++spindex; } } else { int spstart = spindex; while (spindex < mend && kvmeta.get(offsetFor(spindex % maxRec) + PARTITION) == i) { ++spindex; } // Note: we would like to avoid the combiner if we've fewer // than some threshold of records for a partition if (spstart != spindex) { combineCollector.setWriter(writer); RawKeyValueIterator kvIter = new MRResultIterator(spstart, spindex); combinerRunner.combine(kvIter, combineCollector); } }如果job没有定义combiner则直接写文件,如果有combiner则在这里进行combine。
Path indexFilename = mapOutputFile.getSpillIndexFileForWrite(numSpills, partitions * MAP_OUTPUT_INDEX_RECORD_LENGTH); spillRec.writeToFile(indexFilename, job);
rec.startOffset = segmentStart; rec.rawLength = writer.getRawLength(); rec.partLength = writer.getCompressedLength(); spillRec.putIndex(rec, i);5.merge当mapper执行完毕后,就进入merge阶段。首先看下相关的配置参数:
int mergeFactor = job.getInt(JobContext.IO_SORT_FACTOR, 100);mergeFactor:同时merge的文件数。 merge阶段的目的是将多个spill生成的中间文件合并为一个输出文件,这里的合并不同于combiner,无论有没有配置combiner这里的merge都会执行。merge阶段的输出是一个数据文件MapFinalOutputFile和一个index文件。看下相关代码:
RawKeyValueIterator kvIter = Merger.merge(job, rfs, keyClass, valClass, codec, segmentList, mergeFactor, new Path(mapId.toString()), job.getOutputKeyComparator(), reporter, sortSegments, null, spilledRecordsCounter, sortPhase.phase()); //write merged output to disk long segmentStart = finalOut.getPos(); Writer<K, V> writer = new Writer<K, V>(job, finalOut, keyClass, valClass, codec, spilledRecordsCounter); if (combinerRunner == null || numSpills < minSpillsForCombine) { Merger.writeFile(kvIter, writer, reporter, job); } else { combineCollector.setWriter(writer); combinerRunner.combine(kvIter, combineCollector); }说下merge的算法。每个spill生成的文件中keyvalue都是有序的,但不同的文件却是乱序的,类似多个有序文件的多路归并算法。Merger分别取出需要merge的spillfile的最小的keyvalue,放入一个内存堆中,每次从堆中取出一个最小的值,并把此值保存到merge的输出文件中。这里和hbase中scan的算法非常相似,在分布式系统中多路归并排序真是当红小生啊!这里merge时不同的partition的key是不会比较的,只有相同的partition的keyvalue才会进行排序和合并。最后的输出文件类似下图。如果用户定义了combiner,在merge的过程中也会进行combine,因为虽然第四步中combine过但那只是部分输入的combine,在merge时仍然需要combine。这里有人问了,既然这里有combiner,为啥在spill输出时还要combine纳,我认为是因为每次combine都会大大减少输出文件的大小,spill时就combine能减少一定的IO操作。 在merge完后会把不同partition的信息保存进一个index文件以便之后reducer来拉自己部分的数据。
// record offsets rec.startOffset = segmentStart; rec.rawLength = writer.getRawLength(); rec.partLength = writer.getCompressedLength(); spillRec.putIndex(rec, parts);