5、神经递质假说认为，AHC发作时脑脊液和尿中5-羟吲哚乙酸增高，即有5-羟色胺能的功能改变（LeDoux等，1995；Saito等，1998）。有些AHC病人用zonisamide使单胺递质的作用加强，则使症状好转。但此递质假说尚待进一步证明。
6、遗传与AHC的关系也受到重视。Nikati等（1992）报道一种常染色体显性AHC，一家系有5例，男患者有染色体平衡易位，即46XY，t（3；9）（p26；q34）。Joutel等（1993）报道量性遗传性偏瘫型偏头痛伴阵发性共济失调，基因位于染色体19。另有一种显性遗传性一过性瘫痪，称为"大脑动脉病伴皮质下梗塞性脑白质病"，基因也位于染色体19的同一部位。这两种病可能是等位基因病，都有一过性偏瘫，其机制可能与电压依赖性钙通道的基因突变有关。Andermann等（1994）报道一种不典型AHC，称为"良性家族性夜间型交替性偏瘫"，生后4～5个月开始屡发夜间交替性偏瘫，氟桂嗪有效。发育正常。实验室检查正常。父母双方均有偏头痛史，故认为该病是与偏头痛有关的一种遗传病。
