1.做好调查准备
①成立由流行病学、卫生学、临床医师和检验人员组成的疫情处理小组。②经费预算：预算购置必要的器材、设备、药品、试剂、交通等费用。③物资准备：准备好调查表格、培养基、采样器皿、诊断血清、防治药品、消毒杀虫药械及车辆等。
2.建立调查
组织建议当地政府成立紧急疫情处理领导小组和疫情处理技术指导小组，负责指挥疫情处理和质量考评。
3.核实诊断，判断流行强度通过调查基本情况及典型病例，根据临床、流行病学及实验室检查，明确诊断。根据疫情的特点，判断是否为暴发。
4.收集调查
资料收集内容主要包括①个案流行病学调查资料;②疾病监测资料，特别是肠道传染病监测资料;③饮食饮水资料;④人口统计资料;⑤自然因素资料：包括水文、地理、气候、动植物分布及昆虫活动情况等;⑥社会经济特征资料：主要包括生产及生活条件、风俗习惯、医疗防疫条件、经济及文化水平、宗教信仰等;⑦家畜的种类、数量、分布、饲养方法及传染病情况;⑧重点人群的体检资料，各种防疫措施效果和预防接种、预防服药情况等。
5.采集与贮运
标本在实施防疫措施前，及时采集下列标本。①血标本：在病程1～2周，以无菌方式采集5ml血液放人增菌培养基中。若做肥达试验需采集患者急性期和恢复期双份血清。②粪便标本：采集病程为第3～4周的患者或密切接触者粪便1～2g，置于增菌液或CarryBlair运送培养基中。③采集病程为3～4周的患者中段尿液50ml，离心取沉淀物置于增菌液或直接分离。④骨髓标本：采集病程为3～4周的病人骨髓。⑤采集水源水、可疑食物，置于无菌容器中，尽快送检，运送时间超过2小时应冷藏送检。
