电子手册管理下的保税加工货物报关
进出境货物报关―深加工结转报关―其他保税加工货物的报关
（1）进出境货物报关
①报关清单的生成
企业在加工贸易货物进出口报关前，应从企业管理系统导出料号级数据生成归并前的报关清单或通过电子口岸电子手册系统按规定格式录入档次进出口的料号级清单数据，并向电子口岸数据中心报送。
②报关单的生成
数据中心按归并关系和其他合并条件，将企业申报的清单生成报关单。企业通过中小企业模式联网监管系统的报关申报系统调出清单所生成的报关单信息后，将报关单上剩余各项填写完毕，即可生成完整的报关单，向海关进行申报。
如属异地报关的，本地企业将报关单补充完整后，将报关单上载，由异地报关企业下载报关单数据，进行修改、补充后向海关申报。
③报关单的修改、撤销
异地报关的报关单被退单，且涉及修改表体商品信息的，应该由本地企业从清单开始修改，并重新上载报关单，异地下载后重新申报；如仅需修改表头数据的，则可在异地直接修改报关单表头信息后，直接向海关申报。（有关许可证件管理和税收征管的规定与纸质手册管理下的保税加工货物进出境报关一样，参照纸质手册部分的有关内容。
（2）深加工结转报关
电子手册保税加工货物深加工结转报关与纸质手册管理下的保税加工货物深加工结转报关一样，参照纸质手册部分的有关内容。
（3）其他保税加工货物报关
电子手册模式的联网企业以内销、戒指、退运、放权、销毁等方式处理保税进口料件、成品、副产品、残次品、边角料和受灾货物的报关手续与纸质手册管理下的气体保税加工货物报关一样，参照纸质手册部分的有关内容。
后续缴纳税费时，同样要缴纳缓税利息（边角料除外）。缓税利息计息的起始日期为内销料件或者制成品所对应的加工贸易合同项下的电子手册记录的首批料件进口之日，截止日为海关签发税款缴款书之日。
