博士中期考核自我鉴定:
而作为我们博士研究生,当前最紧要的工作就是完成自己的课题,向国家交出一份完美的答卷,也为自己的科研事业开启一个良好的开端。在这段时间的研究生学习中我主要完成了以下几方面的工作。
首先,我在现有资料的基础上,对昆虫纲中的线粒体基因组的密码子组成和tRNA分析的使用情况进行了统计分析。结果表明,在昆虫的线粒体基因组中,有10种最优密码子的使用和其对应的tRNA分子没有明确的对应关系。这一结论与之前大家在核基因组中的观点是不同的,而且已经在哺乳动物、鱼类和真菌的线粒体基因组中得到证明。
其次,考虑到线粒体基因是编码细胞内氧化磷酸化过程中主要的复合酶,同时这一过程中也有核基因的参与,且这一过程是细胞中唯一一个同时有核基因和线粒体基因共同参与的过程,它们之间存在着协同进化的关系。我们以黑腹果蝇 (Drosophila melanogaster) 为研究对象,探讨这一过程中核基因以及线粒体基因的密码子组成情况。分析显示氧化磷酸化过程中的核基因和线粒体基因的密码子组成是独立进化的,虽然它们之间存在协同进化的关系,但是这种协同进化并不影响它们的密码子组成。在密码子分析的过程中,由于Wolbachia和昆虫的线粒体基因组具有比较高的相似度,例如具有共同的祖先-蛋白菌,以及都具有母系遗传的特点,我们设想能否从Wolbachia核基因组和昆虫的线粒体基因组的密码子组成或别的方面来寻找它们具有共同祖先的证据。我们已黑腹果蝇中的专性寄生菌Wolbachia pipientis wMel为研究对象,初步分析表明Wolbachia的核基因组的密码子组成主要是受到基因组的核苷酸组成和基因长度的影响。但是如何进一步讨论它和寄主线粒体基因的相似性,还需要进一步的研究。
再次,在以上的分析过程中,我们用到了一个参数CAI (codon adaptation index) 值,这个参数尽管存在比较大的争议,但是却具有比较大的用途。在一些刚测出全序列的基因组中,一些基因的表达数据由于缺少EST数据和基因芯片数据,而通过实验证明比较费时,且成本比较高,那么我们就可以使用CAI值来进行估计一些未知基因的表达水平的高低。CAI值我们称为密码子适应指数,它的变化范围位于0到1.0之间。它的值越高意味着具有较高的密码子偏好性,以及较高的表达水平(Sharp and Li 1987)。在20XX年,有10条果蝇的全基因组被成功测序,为我们进行生物学研究提供了足够的数据支持。我们从中下载了7种果蝇中与Aggressive相关的基因CYP6A20,通过比较这其中果蝇的CYP6A20基因的CAI值,我们对这7种果蝇的Aggressive水平进行了推测。需要声明的是,由于我们缺少行为学的直接证据,而且CAI值的计算也存在偏差,我们的结果可能会出现偏差,但是CAI值在后基因组时代的应用会越来越广。
最后,我们探讨了榕小蜂的生活环境对于它的氧化磷酸化基因的影响。无论是传粉榕小蜂,还是非传粉榕小蜂,一生中的大部分时间都是生活在榕树的瘾头花序中。这个密闭的花序中,氧气的含量必然会低于外界的含量,生物体在氧气浓度比较低的环境中,进行生命活动必然会消耗更多的能量,对生物体自身的能量供应系统提出更高的要求,那么这种特殊的生活环境是否会对榕小蜂中氧化磷酸化系统中的基因造成影响呢?本实验中,我们拟选取生活在果内榕小蜂的取材:标本的选取:榕小蜂6种(Ceratosolen solmsi、Apocrypta bakeri、Philotrypesis sp、Philotrypesis pilosa、Walkerella spp、Eupristina sp)、广肩小蜂2种(Sycophila属)以及和榕树不相关的小蜂2种。至于榕小蜂的取样上面,我认为选取6种即可,可以进行多个物种之间的比较;而生活在果外的小蜂,我们可以选择不是寄生在榕树上的广肩小蜂作为对照。但是还有一个问题是这种不同的物种之间的差异如何证明不是由种间差异造成的,还是由生活的环境不同说造成的。最好能够选择这样的小蜂,在一个科中,部分物种是生活在果内的,另外部分物种是生活在果外的,这样可以进行对照,可以最大限度上的排除种间差异。
在研究生学习期间,尽管实验比较紧,任务量比较大,但是我仍然抓住点滴时间进行锻炼,以更饱满的精力投入到科研工作当中。经过不懈的努力,身体素质过硬,足以承担繁重的实验任务。在以后的工作和学习中,我将以更加充沛的精力和热情来迎接更具有挑战性的工作。三十功名尘与土,八千里路云和月,我只有竭尽全力为祖国的科研事业贡献自己的一份力量,才能不辜负党和学校对我的关怀。